Normalmente quanto maior o organismo mais e a resistente a radiação UV.
A dosagem de radiação é medida em Mv/S/cm2, de maneira que o organismo alvo só será atingido se passar a certa velocidade do tubo do filtro, que encapsula a lâmpada como vemos abaixo.

Então, vamos à prática:

Em primeiro lugar; a lâmpada germicida (marcas conceituadas como Philips, GE e outras), só emite a radiação germicida necessária a temperaturas entre 40 e 40,5oC. Isso quer dizer que para um filtro UV funcionar direito, ele tem que ter um compartimento que chamamos "luva", que abrigará a lâmpada para que ela permaneça acesa na temperatura correcta. Além disso, a luva tem que ser produzida apenas e somente de material transparente, que permita a passagem de UV e que não se estrague em contacto com ela para nossa felicidade essa coisa incrível existe e se chama "luva de quartzo". O quartzo é o único material que pode ser usado em filtros que pretendam ser 100% eficientes. 
Não quero dizer que os filtros comuns que encontramos no mercado não funcionem porque não possuem a luva de quartzo, mas o máximo de eficiência possível não passa de 35 a 40%, e os organismos maiores como os parasitas de água salgada citados acima precisariam passar várias vezes pelo filtro, ou passar por ele muito lentamente para serem desabilitados.

Portanto; é necessário na prática usar filtro UV que tenha luva de quartzo.
Um filtro de UV é tão mais eficaz quanto mais lentamente a água do aquário passe por dentro dele. Por isso a relação entre o volume do aquário e o consumo da lâmpada é tão importante. Como a água de nossos aquários geralmente é bastante turva, apesar disso não parecer ser assim para nossos olhos, o tubo que conter a luva de quartzo não pode ter mais que 2,5 cm entre sua parede e a parede da luva. Além dessa distância os raios de luz UV se tornam cada vez menos capazes de eliminar os organismos alvos. 
Toda a água do aquário de maneira teórica passará através do filtro em 24 horas quantas vezes se desejar em escolhendo a bomba de água correcta para este fluxo. Existe uma fórmula para calcular a bomba de água que precisa ter para fazer com que a água passe pelo filtro:
Tempo = 9,2 x (Vol/Vazão)

Exemplo prático: Aquário de 300 litros com bomba de 500 litros por hora: 9,2 X (300/500) = 5,52 horas. Isso quer dizer que a cada 5,52 horas todo o volume do aquário passará pelo filtro dando uma taxa de aproximadamente 4,5 vezes todo o volume de água do aquário em 24 horas. Podemos considerar essa taxa, boa para atingir o objectivo desejado que é eliminar todos os alvos possíveis. 

Só nos falta agora determinar a lâmpada a usar.
15 watts = 3.907 Mw/S/cm2
30 watts = 9.548 Mw/S/cm2

Para o exemplo acima, vemos que uma lâmpada de 15 watts é suficiente, pois ocorrerá a entrada suficiente de energia UV no aquário para atingir o objectivo que são 4,5 vezes em 24 horas o volume total do aquário num comprimento de 18 cm, terminando com 488.375 Mw de UV adicionados em toda a água do aquário (3907 x 500 x 4,5 / 18) em um dia. Isso dá e sobra para atingir mesmo os alvos mais resistentes.

Basta variar a relação entre fluxo, capacidade da bomba e comprimento da lâmpada, e aplicar os valores relacionados para atingir o objectivo desejado.
Pode-se ver facilmente porque é que em água doce para eliminação de algas, costumamos usar filtros e bombas muito menores do que em água salgada, as micro-algas são fáceis de eliminar por precisarem de dosagem menor em Mw/S/cm2.

Portanto, para finalizar não é absolutamente necessário usar bombas de água tão potentes quanto normalmente se recomenda, aliás isso só serve para prejudicar o funcionamento do filtro. É bem inteligente usar um filtro de UV que tenha lâmpada de quartzo (desconfie de filtros demais baratos pois provavelmente a luva será de vidro que filtra radiação UV, pois quartzo é caro). 

A unidade UV deve ser instalada em um lugar de fácil acesso para podermos realizar a manutenção necessária na unidade arejada, evitando-se aquecimento excessivo do equipamento e que não fique recebendo respingo do aquário. Deve-se conectar a unidade preferencialmente na saída de um filtro externo para que haja uma boa filtragem mecânica da água antes de entrar no sistema. Contribuindo assim para manter a eficácia do sistema. Caso não possua um filtro o esterilizador pode ser conectado a qualquer tipo de bomba comum, observando sempre a potência da mesma.